El Tribunal de Cuentas es miembro de varias Organizaciones internacionales de Entidades Fiscalizadoras Superiores, como EUROSAI, INTOSAI y OLACEFS. Ejerce la Secretaría permanente de EUROSAI desde su constitución. Además, mantiene relaciones con el Tribunal de Cuentas Europeo y participa en la auditoría de diversos Organismos internacionales.

El Tribunal de Cuentas mantiene relaciones de coordinación y colaboración con los Órganos de Control Externo de las Comunidades Autónomas, mediante el establecimiento de criterios y técnicas comunes de fiscalización y la realización de actuaciones que garanticen la mayor eficacia de los resultados y eviten la duplicidad en las actuaciones fiscalizadoras.